Albanian Airlines được công ty quốc doanh Albania "Albtransport" thành lập năm 1991 dưới tên "Arberia Airlines". Tháng 5 năm 1992 hãngliên doanh với Tyrolean Airways của Áo và đổi tên thành Albanian Airlines. Hãng bắt đầu chở khách từ ngày 20.6.1995 bằng 1 máy bay De Havilland Canada Dash 8-102. Năm 1997 Tyrolean Airways rút khỏi liên doanh và Albanian tư nhân hóa bằng cách bán cho Tập đoàn "M.A.Kharafi & Sons" trụ sở ở Kuwait. Hãng tổ chức lại dựa trên 1 máy bay Airbus A320-231 thuê của hãng Shorouk của Ai Cập. Năm 2001 hãng có đội máy bay gồm 4 chiếc Tupolev Tu-134, bay thường xuyên trên tuyến đường châu Âu. Tháng 7 năm 2001 hãng bỏ dần loại máy bay Tupolev thay bằng loại máy bay BAe 146. Năm 2003 và 2004 hãng mua thêm 2 máy bay BAe 146 nữa.